福州荻芦、延祥砦（绍兴置，百五十人。乾道七年添招。凡五千人。）
镇江驻紥御前水军（乾道三年，招三百人，淳熙五年增招千五百人。）
沿海水军（乾道六年置，一千人。）
潮州水军（乾道四年置，二百人。）
江阴水军（乾道四年置，三百人。）
广东水军（乾道五年，增至二千人。）
平江许浦水军（乾道七年，七千人，淳熙五年，增五百人。）
江州水军（淳熙三年，招一千人。）
池州都统司水军（淳熙元年千人，嘉定中增至三千人。）
漳州水军（绍熙元年，漳、泉共六百人。）
泉州水军（见上。）
殿前澉浦水军（开禧元年，一千五百人。）
鄂州都统司水军（开禧十五年。）
太平州采石驻紥御前水军（嘉定十四年，五千人。）
建康都统司靖安水军（元隶都统司，嘉定中隶御前。）
马军行司唐湾水军（元隶马军行司，嘉定中隶御前。）
通州水军（乾道五年置。）
池州清溪雁汊控海水军（建炎四年置，百五十人。）
两淮水军（绍兴元年置，二千人。隆兴元年，诏诸州断配海贼刺隶。）